10 Feb. 2015 - Simone Fior

Pattern genomici rivelano i geni coinvolti nell’adattamento all’altitudine in garofano (Dianthus)

Presenta: Simone Fior
Plant Ecological Genetics, ETH Zurich, Svizzera

L’ambiente alpino comprende una moltitudine di habitat caratterizzati da specifici fattori ecologici. Una componente fondamentale che determina la variabilità ecologica all’interno dell’area di distribuzione delle specie è l’altitudine, in quanto con essa variano drasticamente fattori abiotici e, di riposta, anche quelli biotici. La conoscenza attuale sulla genetica alla base dei processi di adattamento all’altitudine nelle piante è ancora limitata, e spesso basata su piante modello in cui la ricerca è facilitata da ampie risorse genomiche. Questo progetto si propone di identificare i geni coinvolti nell’adattamento all’altitudine nelle popolazioni alpine di garofano (Dianthus), utilizzando un approccio genomico volto a rilevare regioni sottoposte a selezione naturale. Utilizzando D. sylvestris e D. carthusianorum come sistemi di studio, abbiamo assemblato il genoma per ciascuna delle specie per consentire lo studio di genomica di popolazione e identificare pattern di selezione. I risultati finora ottenuti mostrano evidenze di "selective sweeps" in regioni contenenti geni con funzioni associate a fattori legati all’altitudine.

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